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ImageJ数值化色谱图

图像具有一定的灰度数值,利用这个属性我们可以将实验图片进行数值化,进而进行可视化,达到定性和定量的相结合,将其应用在论文中是一个不错的选择。

下图是一张色谱条带

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我们需要将其做成下面的图形放在论文中,该怎么弄呢,赶紧来学学的吧!

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软件

FIJI 或ImageJ软件,Origin2019b软件


图文教程

数据提取

1. 使用FIJI打开图片(直接拖拽进去即可),这里我使用的是原始图

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2.我们选择第一条条带进行演示,使用矩形工具进行框选择第一条条带,点击菜单栏-Image-Crop,进行裁剪

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3. 点击左上角File-Save as另存为图片备用

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4. 使用直线工具画一条直线在条带上,然后双击直线工具,可以将线条调整的粗一点

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5. 点击直线分析,Analyze-Plot Profile

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6. 在这里就会出现一张类似的色谱曲线图,其中左下角会有一些参数。点击List,就会出现图形的对应的数据,点击Data你可以将数据保存在csv格式的文件中,点击more你可以对横纵坐标进行设置。这里,我们将数据保存在csv文件中,以方便日后使用。

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软件作图

1. 使用Origin进行作图,将上述数据复制进来,写好纵坐标,横坐标是像素值,我们就不显示了

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2. 通过一系列基础设置就如下所示

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3. 进行导出图即可


一键组图

1. 使用AI/PS/Origin/PPT软件,进行组图,然后导出图片即可

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